עייפות היא הסימפטום הנפוץ ביותר של הפטיטיס אוטואימונית.
סימפטומים נוספים כוללים:

 

בשלבים מתקדמים של המחלה מופיעים סימפטומים אשר אופייניים למחלות כבד כרוניות, דוגמת הצטברות נוזלים בבטן (תופעה הנקראת אסיטיס, ascites) והשפעה על מערכת העצבים המתבטאת בבלבול.

נשים החולות במחלה עלולות לאבד את המחזור החודשי.

הסימפטומים של הפטיטיס אוטואימונית דומים לאלו של הפטיטיס נגיפית, או לאלו של הפטיטיס הנגרמת על רקע שימוש בתרופות מסוימות. לפיכך אין די בסימפטומים המוזכרים כדי לאבחן את המחלה. כדי לאבחן באופן מוחלט יש צורך לבדוק את כל התרופות שהמטופל נוטל כדי לוודא שהסימפטומים אינם תופעת לוואי של אחת מהן, וכן יש צורך לבצע בדיקות דם ואחרות.